MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 39161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008021	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008021	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008021	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008021	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	94987632
5	NC_008021	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	94987632
6	NC_008021	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987632
7	NC_008021	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	94987632
8	NC_008021	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
9	NC_008021	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
10	NC_008021	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	94987632
11	NC_008021	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987632
12	NC_008021	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
13	NC_008021	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987632
14	NC_008021	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	94987632
15	NC_008021	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987632
16	NC_008021	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	94987632
17	NC_008021	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987632
18	NC_008021	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	94987632
19	NC_008021	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	94987632
20	NC_008021	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
21	NC_008021	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987632
22	NC_008021	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	94987632
23	NC_008021	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987632
24	NC_008021	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
25	NC_008021	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987632
26	NC_008021	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	94987632
27	NC_008021	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
28	NC_008021	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
29	NC_008021	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987632
30	NC_008021	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987632
31	NC_008021	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987632
32	NC_008021	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	94987632
33	NC_008021	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008021	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008021	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008021	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008021	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008021	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008021	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008021	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
41	NC_008021	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987633
42	NC_008021	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	94987633
43	NC_008021	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
44	NC_008021	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	94987633
45	NC_008021	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
46	NC_008021	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987633
47	NC_008021	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987633
48	NC_008021	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987633
49	NC_008021	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
50	NC_008021	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
51	NC_008021	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987633
52	NC_008021	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	94987633
53	NC_008021	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987633
54	NC_008021	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	94987633
55	NC_008021	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987633
56	NC_008021	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987633
57	NC_008021	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
58	NC_008021	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987633
59	NC_008021	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987633
60	NC_008021	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94987633
61	NC_008021	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	94987633
62	NC_008021	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987633
63	NC_008021	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	94987633
64	NC_008021	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	94987633
65	NC_008021	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008021	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008021	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008021	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94987634
69	NC_008021	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	94987634
70	NC_008021	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987634
71	NC_008021	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	94987634
72	NC_008021	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008021	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008021	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008021	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008021	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008021	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008021	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008021	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008021	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008021	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
82	NC_008021	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987635
83	NC_008021	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	94987635
84	NC_008021	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	94987635
85	NC_008021	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	94987635
86	NC_008021	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
87	NC_008021	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	94987635
88	NC_008021	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	94987635
89	NC_008021	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
90	NC_008021	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987635
91	NC_008021	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987635
92	NC_008021	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	94987635
93	NC_008021	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
94	NC_008021	AGA	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
95	NC_008021	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
96	NC_008021	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
97	NC_008021	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987635
98	NC_008021	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
99	NC_008021	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987635
100	NC_008021	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987635
101	NC_008021	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
102	NC_008021	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
103	NC_008021	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
104	NC_008021	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987635
105	NC_008021	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987635
106	NC_008021	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987636
107	NC_008021	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987636
108	NC_008021	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	94987636
109	NC_008021	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987636
110	NC_008021	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987636
111	NC_008021	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987636
112	NC_008021	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987636
113	NC_008021	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987636
114	NC_008021	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987636
115	NC_008021	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94987636
116	NC_008021	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987636
117	NC_008021	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987636
118	NC_008021	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987636
119	NC_008021	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987636
120	NC_008021	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	94987636
121	NC_008021	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	94987636
122	NC_008021	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
123	NC_008021	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987637
124	NC_008021	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
125	NC_008021	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	94987637
126	NC_008021	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
127	NC_008021	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	94987637
128	NC_008021	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
129	NC_008021	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
130	NC_008021	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	94987637
131	NC_008021	TGA	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
132	NC_008021	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987637
133	NC_008021	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
134	NC_008021	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
135	NC_008021	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	94987637
136	NC_008021	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
137	NC_008021	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	94987637
138	NC_008021	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
139	NC_008021	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
140	NC_008021	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	94987637
141	NC_008021	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
142	NC_008021	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	94987637
143	NC_008021	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
144	NC_008021	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987637
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146	NC_008021	T	6	6	6338	6343	0 %	100 %	0 %	0 %	94987637
147	NC_008021	TTGA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	94987637
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151	NC_008021	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	94987637
152	NC_008021	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
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163	NC_008021	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
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165	NC_008021	TAG	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
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171	NC_008021	TGAT	2	8	7419	7426	25 %	50 %	25 %	0 %	94987637
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180	NC_008021	TTGA	2	8	7799	7806	25 %	50 %	25 %	0 %	94987637
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183	NC_008021	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987637
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265	NC_008021	ATCAGA	2	12	11102	11113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94987642
266	NC_008021	AGA	2	6	11117	11122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987642
267	NC_008021	A	6	6	11145	11150	100 %	0 %	0 %	0 %	94987642
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270	NC_008021	TAT	2	6	11237	11242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987642
271	NC_008021	A	6	6	11246	11251	100 %	0 %	0 %	0 %	94987642
272	NC_008021	GAT	2	6	11286	11291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987642
273	NC_008021	TGA	2	6	11308	11313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987642
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275	NC_008021	A	6	6	11411	11416	100 %	0 %	0 %	0 %	94987642
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409	NC_008021	A	6	6	16681	16686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_008021	A	6	6	16843	16848	100 %	0 %	0 %	0 %	94987646
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419	NC_008021	GGC	2	6	17075	17080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_008021	AG	3	6	17218	17223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
422	NC_008021	CGA	2	6	17320	17325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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446	NC_008021	TGGT	2	8	18283	18290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_008021	TG	3	6	18792	18797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_008021	TA	3	6	18867	18872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_008021	GAA	2	6	19056	19061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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